中新網(wǎng)重慶11月23日電 (記者 鐘旖)記者23日從西南大學(xué)資源昆蟲高效養(yǎng)殖與利用全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室獲悉，數(shù)字家蠶該實(shí)驗(yàn)室代方銀教授團(tuán)隊(duì)日前正式上線“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(tái)(SilkMeta)。共享作為迄今涵蓋數(shù)據(jù)類型最全、分析放kaiyun官方網(wǎng)站入口數(shù)據(jù)量最大的平臺(tái)家蠶組學(xué)數(shù)據(jù)庫，面向全球科學(xué)家開放。上線

　　據(jù)介紹，全球“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(tái)(SilkMeta)全稱為“家蠶泛基因組和多組學(xué)數(shù)據(jù)分析平臺(tái)”，科學(xué)整合了家蠶泛基因組及多組學(xué)數(shù)據(jù)，家開將具有上千個(gè)種質(zhì)資源的數(shù)字家蠶線下實(shí)體基因資源庫，轉(zhuǎn)化為組學(xué)序列線上數(shù)據(jù)庫，共享實(shí)現(xiàn)“數(shù)據(jù)共享”。分析放這也是平臺(tái)繼2022年該團(tuán)隊(duì)發(fā)布家蠶超級(jí)泛基因組圖譜后，中國科學(xué)家推動(dòng)創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”取得的上線kaiyun官方網(wǎng)站入口又一重大進(jìn)展。

圖為“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(tái)(SilkMeta)頁面。全球西南大學(xué)供圖

　　代方銀介紹，科學(xué)在現(xiàn)代蠶學(xué)研究和育種實(shí)踐中，家蠶泛基因組及多組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)成為科學(xué)家手里不可或缺的基礎(chǔ)資源，合理使用可大大縮短研究和育種的時(shí)間，顯著提高工作效率。但這些數(shù)據(jù)的分析利用，對(duì)一般用戶來講，具有較高的技術(shù)壁壘，成本也很高。

　　“我們可以把‘?dāng)?shù)字家蠶’共享分析平臺(tái)比喻為一部智能、高效的家蠶基因‘?dāng)?shù)字字典’或‘超級(jí)圖書館’，研究人員能在這里快速獲取家蠶基因組相關(guān)信息。”實(shí)驗(yàn)室博士后陸昆鵬表示，平臺(tái)整合了家蠶泛基因組、轉(zhuǎn)錄組、變異組、表型組等多組學(xué)數(shù)據(jù)和功能基因研究數(shù)據(jù)，并提供開展比較基因組和功能基因組等方面研究的分析工具。目前，平臺(tái)已涵蓋豐富的數(shù)據(jù)內(nèi)容，包括1082個(gè)二代測(cè)序基因組、546個(gè)三代測(cè)序基因組、5000多萬個(gè)基因組變異、1168個(gè)轉(zhuǎn)錄組、294種家蠶質(zhì)量性狀基因型特征、123個(gè)非編碼RNA測(cè)序數(shù)據(jù)以及單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、甲基化測(cè)序數(shù)據(jù)、免疫共沉淀測(cè)序數(shù)據(jù)等。

　　2022年10月，代方銀團(tuán)隊(duì)完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析，成功繪就世界上首張家蠶超級(jí)泛基因組圖譜，率先實(shí)現(xiàn)家蠶基因庫數(shù)字化，創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”。此次“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(tái)的上線，代表著西南大學(xué)家蠶基因研究從“技術(shù)領(lǐng)跑”轉(zhuǎn)變?yōu)椤皵?shù)據(jù)共享”，全球科學(xué)家都能在該平臺(tái)獲得基因數(shù)據(jù)，實(shí)現(xiàn)種質(zhì)資源基因組、遺傳變異及表型的開放共享和可視化、便利化分析。

　　“這是我們發(fā)展道路上里程碑式的成果，希望通過數(shù)據(jù)共享，進(jìn)一步推動(dòng)家蠶基因研究，讓人與自然協(xié)調(diào)發(fā)展?！敝袊こ淘涸菏俊⑽髂洗髮W(xué)蠶學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)研究所所長(zhǎng)向仲懷表示。(完)